Spørgsmålet om, hvorvidt studerende vil benytte software frem for papir til at tage noter til digitale materialer, blev evalueret af nogle studerende i forbindelse med et database-kursus, hvor undervisningsmaterialet var organiseret som en hypertekst. Softwaren, de evaluerede med var Hypergenics Webnize® FavourNotes & Highlighter. De studerendes holdninger var meget forskellige. Et annotationsværktøj vil styrke kvaliteten af en netbaseret, fleksibel undervisning. Sådan lyder konklusionen på forsøget. Men det annotationsværktøj, der blev testet med, var ikke stærkt nok til, at det kan erstatte de studerendes noter på papir. Annotationsværktøjer forventes at gøre større nytte som overordnet og nemt tilgængelig strukturering, hvis undervisningsmaterialet består af flere strukturelt meget forskellige websites. Forsøget her omfattede primært materiale på ét website - og her fik annotationerne karakter af bookmarks.
Det testede annotationsværktøj har desuden nogle begrænsninger: Pdf-filer kan ikke annoteres på ordniveau, og streamet video og audio kan slet ikke annoteres. En afgørende forskel i brugen af et annotationsværktøj vil være, hvis underviser og kursusdeltager på et fleksibelt, netstøttet kursus har det som fælles referencepunkt. I det testede annotationsværktøj foregår dette pr. e-mail.
Det testede annotationsværktøj er kun til individuel brug, og er derfor ikke et stort plus for gruppebaseret undervisning. Det vil et annotationsværktøj være, hvor flere studerende kan ’dele’ annoteringer – f.eks. via klient-server. Der er bedre erfaringer, hvor underviseren bruger annotationer til at introducere materiale eller kommentere/stille opgaver i tilknytning til digitale tekster.